Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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