Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01646 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01646 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01646 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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