Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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CcnkO88874 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CcnkO88874 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CcnkO88874 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CcnkO88874 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcnkO88874 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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