Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cops6O88545 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops6O88545 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops6O88545 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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