Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a1O88207 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a1O88207 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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