Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptpn20O55082 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms