Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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