Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Opn1mwO35599 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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