Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
E2f3O35261 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.6 ms