Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-Q1O19441 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Q1O19441 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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H2-Q1O19441 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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