Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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MsmbO08540 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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