Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm4340L7N2C4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4340L7N2C4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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