Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm21976J3QNN2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm21976J3QNN2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm21976J3QNN2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm21976J3QNN2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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