Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc180J3QNE4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms