Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21746J3QMM6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms