Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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