Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm17535J3KMR8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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