Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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