Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r34G3XA52 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms