Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms