Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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