Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Asgr1-203ENSMUST00000108585 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rnf38-204ENSMUST00000107836 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Metap2-210ENSMUST00000181217 1984 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Xntrpc-201ENSMUST00000084843 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms