Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms