Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm8247F6VRJ8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms