Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21977F6U3N7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21977F6U3N7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms