Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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