Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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