Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms