Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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