Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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