Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms