Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms