Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spocd1B1ASB6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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