Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprsB0V2N1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms