Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms