Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms