Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms