Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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