Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17190V9GX38 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms