Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Top3bQ9Z321 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms