Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms