Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn8Q9Z260 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms