Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Uso1Q9Z1Z0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms