Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms