Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs4Q9Z1T2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms