Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Padi1Q9Z185 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms