Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl8Q9Z121 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl8Q9Z121 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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