Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn9Q9Z0S7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms