Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms