Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Wdr54Q9R0D8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms